本次使用的Android Studio版本为1.3.2

依次打开Settings->Too>External Tools后点击绿色加号按钮添加

Windows平台设置如下：

Program: javahParameters: -v -jni -d $ModuleFileDir$/src/main/jni $FileClass$Working directory: $SourcepathEntry$

如果是Linux平台则Program修改为:/usr/bin/javah

当然如果希望自定义头文件路径的可在-v -jni -d后面将$ModuleFileDir$/src/main/jni修改成想要的路径，这里就不多累赘了。

简单的测试代码:

新建一个Java native类,代码如下

package com.app.silver.jnipro;/** * Created by Silver on 2015/9/14. */public class Native {    public static native String getStringFromJni();    static {        System.loadLibrary("JniPro");    }}

如上图所示，右击Java包下的Native类文件，点击Android Tools->javah则成功编译出Jni所需的头文件

成功结果图如下：

刚从Eclipse转Android Studio，如果有更好的方法欢迎联系，相互交流。

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