microRNA研究的几种新模式……

16lz 2021-05-17

关于microRNA，我们前期已经写了好多文章，大家可以从这篇文章中看到：

开始准备国科金了，我们推荐过哪些热点？。关于microRNA，大家最常说的就是microRNA研究已经过时了，现在要做lncRNA、circRNA，今天我们就来看一看是不是这样。

大家为什么说microRNA研究过时了？

microRNA研究时间相对比较长（10年+），所以基本上以常见（疾病）主题的microRNA研究一抓一大把；
由于microRNA的作用机制相对比较单一，microRNA的研究套路太固定，不像lncRNA可以玩出各种花样来；

第一点没话说，第二点其实小张是不太认同的。

在microRNA的“经典”研究套路中，一般是这样：先做microRNA的细胞功能，然后做分子机制，而分子机制又包括四部分：生物信息学预测（通过Targetscan预测microRNA靶基因），表达相关性（检测microRNA与靶基因表达并确定其表达负相关），功能回复（单因素和多因素，表型和表达挽救）以及荧光素酶报告基因实验。

因为这种文章太多，所以大家觉得也没有新意了，不过是换个microRNA、换个靶基因、换个功能，又是一篇文章了, 而且文章分数在3分左右，大家看看了解套路就可。

下面小张要说的是：microRNA研究也能玩出很多花样来的，我们通过文章看高手们是怎么玩的。

一、多条microRNA

不再只研究一条microRNA了，来个3-5条，这几条microRNA通过调控共同的靶基因或者信号通路发挥功能，说不定这几条还能发挥协同作用，或者选microRNA簇（cluster）为单位进行研究。

microRNA cluster是指基因组位置上比较靠近（比如1Kb）的一些microRNA。最常见的就是mir-17-92簇：

关于microRNA cluster，我们可以通过mirbase进行查询（mirbase：http://www.mirbase.org/）

检索结果：

以microRNA Cluster为主题的研究文章很多，大家可以看这四篇：

最后一篇Immunity说的是microRNA-183-96-182 cluster通过下调转录因子Foxo1表达增加Th17细胞致病性。

都是最新的高分文章，大家可以结合基金找找思路。

二、microRNA本身表达异常

这里可以考虑的因素就很多了，比如：

1） microRNA的转录过程

比如某个转录因子或者信号通路对microRNA前体产生的调控，或者microRNA启动子本身的甲基化：基因启动子有DNA甲基化修饰，同样microRNA也有，而且也会影响转录。因此microRNA甲基化也是一个可以考虑的方向。

比如下面这两篇最新文章研究就是microRNA甲基化分别与肿瘤敏感性和脂肪形成的关系：

还可以考虑对microRNA成熟过程中的各种关键分子的影响，

比如九月份这篇NCB的文章就是研究的通过改造后的RNA结合蛋白Rbfox通过与miR-21前体pre-miR-21结合，并抑制DICER酶和Drosha酶处理pre-miR-21产生miR-21。

当然，如果与lncRNA结合，除了lncRNA作为microRNA的sponge海绵，还可以考虑lncRNA作为microRNA的前体（precursor），比如这篇9月份的MCB文章，研究的就是lncRNA H19作为microRNA-675的前体与RNA结合蛋白HuR结合并调控常表皮屏障功能。

三、 microRNA的转运和定位

我们知道microRNA从细胞核内转录，经过Drosha和DICER酶的剪接，从pri-miRNA到premiRNA再到miRNA成熟体，microRNA定位上从细胞核到胞浆，这个过程就是microRNA的转运定位。

下面这两篇高分文章就是研究的这个过程：

第二篇Cancer Cell研究的就是ERk通过磷酸化Exportin-5这个蛋白导致microRNA表达全局性的下调：

当然，关于microRNA的定位，我们还有一个方向：外泌体介导的microRNA外排到胞外，即通过外泌体这个途径microRNA在细胞间发挥功能，比如今年3月份的这篇文章：

说的就是基质细胞通过外泌体将microRNA-21传递给卵巢癌细胞，调控APAF1表达导致紫杉醇耐药，这篇文章我们写过：

（策略篇）S4E16：外泌体与肿瘤耐药有关的基金和文章。

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